เรื่องราวของเกม Far Cry 3 ก็มีอยู่ว่า Jason Brody พร้อมกับเพื่อนและแฟนสาว ได้เดินทางไปเที่ยวทะเล ที่เกาะทางใต้แห่งหนึ่ง โดยที่ไม่รู้ตัวเลยว่าฝันร้ายกำลังรอพวกเขาอยู่ โดยที่ระหว่างเที่ยวกันอยู่นั้น พวกของ Jason Brody ก็ไปพบกับเรือร้างโดยบังเอิญและพบว่าในนั้นมีอาวุธสงครามเต็มไปหมด จึงถูกลากเข้าไปพัวผันกับกลุ่มที่ขัดแย้งกันในท้องถิ่นนั้นโดยไม่รู้ตัว หลังจากนั้นพวกเขาก็ถูกมอมเหล้า และ Jason Brody ถูกจับไปโดยแยกกับเพื่อนและแฟนสาว เขาดิ้นรนและหนีออกไปได้สำเร็จก่อนที่จะถูกเจี๋ยน แต่ฝันร้ายของเขาก็ยังไม่หมดไป เพราะกลุ่มก่อการร้ายยังคงตามล่าตัว และเขายังต้องตามหาแฟนสาวกับเพื่อน และหนีออกไปด้วยกันให้ได้ การต่อสู้ของหนุ่มนักท่องเที่ยวผู้ไม่ชำนาญการต่อสู้จะจบอย่างไร คุณต้องเป็นผู้ช่วยเหลือ